必威betway西汉姆占翔课题组与合作者以“Integrative Analysis of Microbial 16S Gene and Shotgun Metagenomic Sequencing Data Improves Statistical Efficiency in Testing Differential Abundance”为题在国际权威期刊JASA（《美国统计学会会刊》）发表论文，提出Com-2Seq方法，用于基于16S rRNA基因测序数据与宏基因组测序数据的整合分析，显著提升了检测微生物差异丰度的准确性。
16S rRNA基因测序和鸟枪法宏基因组测序是微生物研究中被广泛使用的两种测序技术，且许多微生物组研究对同一样本队列同时开展了这两类测序实验。两种测序数据集往往揭示出一致的微生物特征模式，这表明对两类数据进行整合分析可以提升对这些特征的检验效能。然而，两类测序技术在实验偏差上的差异、样本的部分重叠以及文库大小的不均，给两类数据的合并带来了巨大挑战。
本文提出的Com-2seq方法首次克服上述困难，将两类数据联合用于微生物属水平及群落水平的差异丰度检验。模拟研究表明，Com-2seq相较于单一数据集分析显著提高了统计效率，并优于两种临时性的整合分析方法。在对真实微生物组数据的分析中，Com-2seq发现了具有科学合理性的结果，且这些结果若仅分析单一数据集则会被遗漏。该成果为高效分析海量不同测序技术下得到的微生物测序数据的融合分析提供重要的方法与工具，新提出的整合分析范式有助于提高微生物学研究的科学发现。
bw·西汉姆联占翔教授、华中农业大学陈轩教授、北京大学胡懿娟教授为论文通讯作者。该研究得到国家自然科学基金项目（12371287）资助。
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